نظراً للمكانة العلمية التي يحظى بها مركز كربلاء للدراسات والبحوث في العتبة الحسينية المقدسة بين الأوساط العلمية النخبوية لما يقدمه من برامج علمية نافعة في المجالات كافة وخاصة في المجالين التأريخي والديني ضمن خطاب الوسطية والاعتدال أدفع بالمؤسسات والمراكز في الرغبة بالعمل المشترك مع المركز.
وبناءً على الطلب المقدم من قبل مؤسسة القبس للثقافة والتنمية الذي يرغب فيه بالتوأمة مع المركز فقد حصلت موافقة سماحة المتولي الشرعي للعتبة الحسينية المقدسة " الشيخ عبد المهدي الكربلائي" على افتتاح فرع لمركز كربلاء للدراسات والبحوث بالتوأمة مع مركز القبس الجامعي/ بغداد، وذلك لإقامة البرامج والندوات والمؤتمرات التي تسعى بأهدافها وغاياتها الى بناء الانسان والمجتمع، وبناءً على الموافقة الحاصلة سيتم عقد اجتماعات مشتركة لغرض الاتفاق على الأمور الفنية للعمل.
ومن الجدير بالذكر ان مؤسسة القبس هي احدى منظمات المجتمع المدني ومقرها في بغداد ولها نشاطات متعددة